شایان ذکر است که محمد جعفر قائم پناه از جمله پزشکانی بود که در جریان فتنه سال ۱۴۰۱ عملکرد خلاف منافع ملی داشته و در تاریخ( ۷آذر ۱۴۰۱) نه تنها در ویدئویی هدفمند نسبت به استفاده ماموران از تفنگ ساچمه‌ای و نابینا شدن معترضان پرداخته بود؛ بلکه در نامه ای که در تاریخ ۲۸ آبان ۱۴۰۱ منتشر شده بود خطاب به دبیرکل انجمن چشم پزشکی ایران خواستار پیگیری نامه‌ی چند روز پیش اساتید و فوق تخصص‌های شبکیه درباره‌ی عوارض گلوله های ساچمه‌ای و پینت بال شده بود.

در نامه دکتر قائم پناه دکتر جبارونددبیرکل انجمن چشم پزشکی ایران آمده بود: «ما چشم پزشکان ایران زمین – که بهترین سالهای عمر خود را وقف کسب دانش و مهارت در جهت نجات بینایی و چشم‌های انسان‌ها کرده‌ایم و ردای خدمت به نور و روشنایی پوشیده‌ایم- بر خود فرض می‌دانیم که پیگیر پاسخگویی مطالباتی باشیم که در نامه قبلی گروه محترم ویتره و رتین درمورد عوارض چشمی غیرقابل جبران ونابینایی ناشی از به کار گیری گلوله‌های ساچمه ای و پینت بال در حوادث اخیر بیان شده بود.

وی در این نامه نوشته بود: از شما درخواست داریم که نتایج پیگیری‌های خود را به طور شفاف با جامعه چشم پزشکی در میان بگذارید.»